RNA pull down（RNA和蛋白互作）

RNA pull down（RNA和蛋白互作）

RNA pull down是體外研究RNA與蛋白互作的一項重要技術。該技術是用biotin標記體外轉錄的靶RNA分子，再用鏈霉親和素純化出與靶RNA結合的蛋白復合體，洗脫得到RNA結合蛋白質。再通過Western blot實驗檢測特定的RNA結合蛋白是否與靶RNA結合；或通過質譜儀檢測可以篩選出與靶RNA結合的蛋白。

biotin與鏈霉親和素間的作用，是目前已知強度最高的非共價作用。其中，活化biotin可以在蛋白質交聯劑的介導下，與已知的幾乎所有生物大分子偶聯。因此，用biotin標記核酸后，可以純化出與該核酸結合的各種生物大分子復合物。

實驗流程

• 探針設計及標記：體外轉錄或合成獲取RNA，biotin標記;

• pull-down：與細胞裂解液孵育，形成RNA-蛋白質復合物。該復合物可與鏈霉親和素磁珠結合，從而把靶RNA結合蛋白從細胞裂解液中分離出來，經過洗滌將非特異性結合蛋白質去除；最后，洗脫得到與靶RNA結合的蛋白質復合物；

• 互作蛋白質鑒定：再經過Western Blot或質譜(MS)鑒定蛋白質。

服務內容

• 體外轉錄或合成RNA，biotin標記；

• 細胞培養與細胞裂解液制備；

• pull-down捕獲互作蛋白；

• Western blot驗證特定的蛋白；

• MS鑒定潛在的互作蛋白。

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