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        DAP-seq(DNA親和純化測序)

        更新時(shí)間:2025-04-14   點(diǎn)擊次數(shù):1053次

        無需特異性抗體,無需轉(zhuǎn)基因材料,物種不限(動(dòng)物,植物,微生物),高通量檢測轉(zhuǎn)錄因子在全基因組的結(jié)合位點(diǎn)

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        在基因功能組學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究中,轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)(Transcription Factor Binding Sites, TFBS)的發(fā)掘一直是研究熱點(diǎn)之一。傳統(tǒng)的ChIP-seq(染色質(zhì)免疫共沉淀測序)方法,在抗體質(zhì)量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。然而,好的抗體可遇不可求,這限制了ChIP-seq更廣泛的應(yīng)用。

        2016年,O'Malley RC等人在Cell上發(fā)表了使用DAP-seq技術(shù),快速繪制轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控靶向DNA區(qū)域圖譜的文章。2017年,Bartlett A等在Nature Protocols上發(fā)表了DAP-seq的實(shí)驗(yàn)方法。DAP-seq技術(shù)使TFBS的研究不再局限于任何生物,不再受抗體質(zhì)量的限制,為生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域轉(zhuǎn)錄因子的研究提供了新型高效的工具。

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        技術(shù)流程

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        已做物種

        植物:

        84K楊、桉樹、白菜、白菜型油菜、白樺、白木香、百脈根、稗草、板栗、菠菜、菠蘿、博落回、菜豆、藏紅花、茶樹、大豆、大馬士革黑種草、大麥、大青楊、大葉秦艽、丹參、地錢、冬瓜、冬棗、杜梨、短小蛇根草、二色補(bǔ)血草、番茄、甘薯、甘野菊、甘蔗、柑橘、高加索三葉草、高粱、狗尾草、谷子、海島棉、旱柳、核桃、紅薯、胡蘿卜、花生、黃瓜、黃連、蒺藜苜蓿、角果堿蓬、結(jié)縷草、芥藍(lán)、金針菇、莖瘤芥、九葉青花椒、菊花、苦蕎、辣椒、藍(lán)花耬斗菜、荔枝、蓮、陸地棉、落葉松、馬鈴薯、馬尾松、毛白楊、毛果楊、毛葡萄、毛竹、玫瑰、梅、獼猴桃、棉花、閩楠、牡丹、木薯、擬南芥、歐洲甜櫻桃、蘋果、葡萄、臍橙、茄子、青蒿、青錢柳、楸樹、球等鞭金藻、人參、軟棗獼猴桃、三角褐指藻、桑樹、草莓、山金柑、山桃、杉木、生菜、柿子、疏花水柏枝、栓皮櫟、水稻、酸棗、甜橙、甜瓜、小白菜、夏堇、香椿、香蕉、向日葵、橡膠、小黑楊、小麥、小葉楊、杏、鴨茅、煙草、鹽芥、燕麥、楊梅、楊樹、銀杏、油菜、油松、油桐、玉米、圓葉櫻桃、月季、雜花苜蓿、雜交楓香、棗、芝麻、枳、中帶鼓藻、竹葉花椒、紫菜、紫花苜蓿、紫薇、無患子、717 楊、百合、百歲蘭、伴礦景天、不結(jié)球白菜、菜心、滇楊、短芒大麥草、粉葛、鳳梨、甘菊、甘藍(lán)、甘藍(lán)型油菜、剛毛檉柳、枸杞、光皮樺、黑麥草、胡楊、黃花蒿、黃花棘豆、灰楊、灰氈毛忍冬、集胞藻、藜麥、柳枝稷、龍須菜、麻瘋樹、麻竹、蔓菁、芒果、木荷、歐美楊、歐洲云杉、椪柑、普通煙草、千金子、山新楊、芍藥、司篤克氏棉、苔蘚、桃、甜菜、鐵皮石斛、無花果、西瓜、西葫蘆、橡膠樹、小蘭嶼蝴蝶蘭、小立碗蘚、野大豆、櫻桃、圓果種黃麻、圓柱擬脆桿藻

        動(dòng)物:

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        真菌:

        擬輪枝鐮孢菌、豬苓真菌、意大利青霉、草酸青霉、金黃殼囊孢、靈芝、糙皮側(cè)耳、草菇、灰蓋鬼傘、蟲草、亞洲鐮刀菌、蝗綠僵菌、裂殖壺菌、禾谷鐮刀菌、元蘑、疫霉、高盧蜜環(huán)菌、灰霉菌

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        路德維希腸桿菌、嗜熱厭氧桿菌、生氮假單胞菌、布魯氏菌、肺炎克雷伯菌、類球紅細(xì)菌、紅桿菌科細(xì)菌、成團(tuán)泛菌、銅綠假單胞菌、伯克霍爾德菌、巴西固氮螺菌、大腸桿菌、根瘤菌、解淀粉芽孢桿菌、美人魚發(fā)光桿菌、膿腫分枝桿菌、殺魚愛德華氏菌、嗜水氣單胞菌

        部分轉(zhuǎn)錄因子家族DAP-seq成功率參考:

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        注:以上僅供參考,具體轉(zhuǎn)錄因子成功率以實(shí)驗(yàn)為準(zhǔn)。

        部分客戶發(fā)表文章:

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        聯(lián)


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